有时我们会碰到处理后的污水其他指标都达标，含磷指标不到标，主要原因有以下几点：
　　一、溶解氧
　　先在厌氧区控制严格的厌氧环境。这直接关系到聚磷菌的生长状况、释磷能力及利用有机基质合成PBH的能力。其次是在好氧区提供充足的溶解氧。以便聚磷菌对储存的PHB进行降解，释放能量供其过量摄磷之用，以便吸收废水中的磷。一般厌氧段的DO要严格控制在0.2mg/L以下，二好氧段的DO要控制在2mg/L以上。
　　二、硝酸盐含量
　　硝态氮的存在也会消耗有机基质而抑制聚磷菌对磷的释放，进而影响好氧条件下聚磷菌对磷的吸收。另外，硝态氮的存在会被部分聚磷菌作为电子受体进行反硝化，从而影响其以发酵产物作为电子受体进行发酵产酸、抑制聚磷菌的释磷和摄磷能力及PBH的合成能力。
　　三、温度
　　一般在5~30℃范围内，可以有一个较好的除磷效果。
　　四、PH值
　　PH值在6~8时，磷的释放比较稳定。
　　五、BOD5负荷和有机物性质
　　一般进水BOD5/TP大于15，才可以获得不错的除磷效果。为此，可以采用部分进水和跨越初沉池的方法，获得除磷所需的BOD5量。
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